报关员组织部门为海关总署。且前者的报考门槛放低。前者考两科，只要高中毕业就可以，这就表示在校大学生也可考；后者需要大专学历以上：报关基础知识和报关业务技能二者皆是想要参加报关行业工作的人员去考，报关员已于2013年停考，后者只考一科。前者是所有参考者申请证书即可获得证书。报关协会2014年开始组织报关水平测试，而后者需达到合格分数才可拿证。前者建立人才库，更方面企业选人，也方便考生就业。后者不曾没有人才库。前者证书体现成绩外还将体现在全国考生中所处水平，更直观。后者没有成绩体现